Lintasan darat

Terdapat hanya tiga lintasan sempadan darat secara rasmi, kesemuanya terletak di antara Sarawak dan Kalimantan Barat :

• Antara Tebedu, Sarawak dan Entikong, Kalimantan Barat . Lintasan ini adalah di sepanjang laluan utama antara Kuching, ibu negeri Sarawak, dan Pontianak, ibu negeri Kalimantan Barat.
• Antara Biawak, Sarawak dan Aruk, Kalimantan Barat . [36] [37]
• Antara Lubok Antu, Sarawak dan Nanga Badau, Kalimantan Barat [38] [39]

Terdapat banyak lagi lintasan tidak rasmi antara Negara Indonesia dan Negara Malaysia di sepanjang sempadan darat, seperti:

• diantara Serikin, Sarawak dan Jagoi Babang, West Kalimantan
• diantara Bakelalan, Sarawak dan Long Bawan, North Kalimantan

Lintasan ini kebanyakannya digunakan oleh penduduk tempatan dan sejumlah perdagangan rentas sempadan dan penyeludupan berterusan di kawasan ini dan lintasan haram yang lain. Pendatang tanpa izin juga diketahui ada menggunakan lintasan tersebut.

lintasan laut

Terdapat banyak lintasan laut berjadual antara Indonesia dan Malaysia, kebanyakannya antara pelabuhan di bekas pulau Sumatera dan Semenanjung Malaysia . Berikut ialah senarai pelabuhan (pelabuhan Indonesia diikuti oleh pelabuhan Malaysia) di mana perkhidmatan bot berjadual beroperasi setakat April 2008:

Sumatera-Semenanjung Malaysia

Kalimantan Utara-Sabah

• Nunukan - Tawau
• Tarakan - Tawau
• Sungai Nyamuk - Tawau